Nghị định 141/2026/NĐ-CP là một thay đổi đáng chú ý với hộ kinh doanh, cá nhân kinh doanh và doanh nghiệp nhỏ, đặc biệt trong bối cảnh nhiều nhà thuốc, quầy thuốc đang chuẩn bị cho giai đoạn quản lý thuế chặt chẽ hơn từ năm 2026. Điểm được quan tâm nhất là ngưỡng doanh thu không phải nộp thuế giá trị gia tăng và thuế thu nhập cá nhân của hộ kinh doanh được nâng lên 01 tỷ đồng/năm, thay vì mức 500 triệu đồng như trước đó.

Với chủ nhà thuốc, thay đổi này không chỉ là câu chuyện “có phải nộp thuế hay không”. Nó còn ảnh hưởng đến cách theo dõi doanh thu, thời điểm kê khai, việc dùng hóa đơn điện tử, xử lý khoản thuế đã nộp thừa và cả cách chuẩn bị dữ liệu bán hàng hằng ngày. Bài viết dưới đây tổng hợp các điểm mới quan trọng của Nghị định 141/2026/NĐ-CP theo hướng dễ hiểu, phù hợp cho nhà thuốc và quầy thuốc nhỏ tham khảo khi vận hành thực tế.

Tóm tắt nhanh: Nghị định 141/2026/NĐ-CP nâng ngưỡng doanh thu không phải nộp thuế của hộ kinh doanh lên 01 tỷ đồng/năm, đồng thời bổ sung cơ chế miễn, bù trừ hoặc hoàn thuế cho một số trường hợp.

Nghị định 141/2026/NĐ-CP thay đổi gì với hộ kinh doanh nhà thuốc?

Nghị định 141/2026/NĐ-CP có điểm nổi bật là nâng ngưỡng doanh thu của hộ kinh doanh, cá nhân kinh doanh từ 500 triệu đồng lên 01 tỷ đồng/năm khi xác định nghĩa vụ thuế. Với nhà thuốc và quầy thuốc nhỏ, điều này có thể giúp giảm áp lực thuế nếu doanh thu thực tế nằm trong ngưỡng theo quy định hiện hành.

Theo nội dung bài gốc, Nghị định 141/2026/NĐ-CP sửa đổi một số quy định tại Nghị định 68/2026/NĐ-CP liên quan đến chính sách thuế và quản lý thuế với hộ kinh doanh, cá nhân kinh doanh. Cụ thể, hộ kinh doanh có doanh thu năm không vượt quá 01 tỷ đồng thuộc diện không phải nộp thuế giá trị gia tăng và thuế thu nhập cá nhân, tùy điều kiện áp dụng cụ thể.

Trong ngành dược, nhiều cơ sở vận hành theo mô hình hộ kinh doanh: một quầy thuốc gia đình, một nhà thuốc nhỏ tại khu dân cư hoặc cửa hàng bán kết hợp thuốc, thực phẩm bảo vệ sức khỏe, thiết bị y tế cơ bản. Với nhóm này, việc xác định doanh thu hằng năm rất quan trọng vì chỉ cần vượt ngưỡng, nghĩa vụ kê khai và sử dụng hóa đơn điện tử có thể thay đổi.

Tuy vậy, chủ nhà thuốc không nên hiểu đơn giản rằng “dưới 01 tỷ là không cần làm gì”. Theo quy định hiện hành, hộ kinh doanh vẫn nên theo dõi doanh thu đầy đủ, lưu chứng từ bán hàng, ghi nhận dòng tiền và kiểm tra hướng dẫn cụ thể từ cơ quan thuế địa phương. Phần mềm quản lý nhà thuốc Omini có thể hỗ trợ chủ nhà thuốc tổng hợp doanh thu theo ngày, tháng, quý để dễ đối chiếu khi cần kê khai hoặc giải trình.

Làm sao để biết nhà thuốc có thuộc ngưỡng doanh thu 01 tỷ đồng/năm?

Để biết nhà thuốc có thuộc ngưỡng 01 tỷ đồng/năm hay không, chủ cơ sở cần theo dõi tổng doanh thu thực tế trong năm, không chỉ nhìn vào lợi nhuận. Nói cách khác, doanh thu bán hàng là chỉ số cần kiểm soát thường xuyên, còn chi phí và lãi lỗ là câu chuyện quản trị riêng.

Với Nghị định 141/2026/NĐ-CP, điểm quan trọng là ngưỡng doanh thu được dùng để xác định việc hộ kinh doanh có phải nộp thuế giá trị gia tăng và thuế thu nhập cá nhân hay không. Vì vậy, chủ nhà thuốc nên có một cách ghi nhận doanh thu thống nhất, đặc biệt khi bán qua nhiều kênh như bán trực tiếp tại quầy, giao hàng cho khách quen, bán qua Zalo, Facebook hoặc sàn thương mại điện tử.

Một số việc nên làm trong thực tế:

• Ghi nhận đầy đủ doanh thu bán lẻ tại quầy theo từng ca bán hàng.
• Tách rõ doanh thu bán thuốc, thực phẩm bảo vệ sức khỏe, mỹ phẩm, thiết bị y tế nếu cần quản trị sâu hơn.
• Theo dõi doanh thu theo tháng để ước tính khả năng vượt ngưỡng 01 tỷ đồng/năm.
• Đối chiếu doanh thu tiền mặt, chuyển khoản, ví điện tử và doanh thu qua sàn.
• Lưu chứng từ, hóa đơn đầu vào, phiếu nhập hàng và dữ liệu bán hàng để phục vụ kiểm tra khi cần.

Với nhà thuốc nhỏ, sai sót thường gặp là chỉ nhìn vào tiền còn lại cuối tháng rồi ước lượng doanh thu. Cách này dễ thiếu chính xác vì dòng tiền có thể bị ảnh hưởng bởi nhập hàng, công nợ nhà cung cấp, hoàn hàng hoặc chi phí vận hành. Phần mềm quản lý nhà thuốc Omini nên được dùng như một nơi ghi nhận doanh thu bán hàng gốc, từ đó giúp chủ cơ sở có dữ liệu rõ ràng hơn khi đánh giá nghĩa vụ thuế.

Khi nào hộ kinh doanh mới phải kê khai theo quý?

Theo Nghị định 141/2026/NĐ-CP, hộ kinh doanh mới ra kinh doanh trong năm 2026 cần chú ý thời điểm bắt đầu hoạt động và mức doanh thu thực tế. Nếu doanh thu vượt 01 tỷ đồng, hộ kinh doanh có thể phải chuyển sang kê khai theo quý từ quý phát sinh, theo hướng dẫn áp dụng của cơ quan thuế.

Với hộ kinh doanh bắt đầu trong 6 tháng đầu năm, nếu doanh thu không vượt 01 tỷ đồng thì bài gốc nêu rằng hộ cần thông báo doanh thu 2 lần: trước ngày 31/7 và trước ngày 31/1 năm sau. Nếu bắt đầu trong 6 tháng cuối năm, hộ thông báo 1 lần trước ngày 31/1 năm sau. Đây là mốc thời gian chủ nhà thuốc nên ghi chú lại để tránh quên nghĩa vụ thông tin, nhưng vẫn nên kiểm tra biểu mẫu và hướng dẫn mới nhất với cơ quan quản lý thuế.

Trong thực tế, nhà thuốc mới mở thường có doanh thu tăng dần theo thời gian. Ba tháng đầu có thể thấp, nhưng khi đã có khách quen, doanh thu có thể tăng nhanh, nhất là ở khu dân cư đông hoặc gần phòng khám. Vì vậy, không nên đợi đến cuối năm mới cộng số liệu. Chủ nhà thuốc nên xem báo cáo doanh thu lũy kế hằng tháng để biết mình đang ở mức nào so với ngưỡng 01 tỷ đồng.

Nếu dùng phần mềm quản lý nhà thuốc Omini, chủ cơ sở có thể thiết lập báo cáo doanh thu theo kỳ để theo dõi xu hướng. Việc này không thay thế tư vấn pháp lý hoặc kế toán thuế, nhưng giúp giảm rủi ro bị động khi doanh thu tiến sát ngưỡng kê khai.

Vì sao hóa đơn điện tử vẫn là vấn đề nhà thuốc cần chuẩn bị?

Hóa đơn điện tử vẫn cần được chuẩn bị vì khi doanh thu vượt ngưỡng theo quy định hiện hành, hộ kinh doanh có thể thuộc diện bắt buộc sử dụng hóa đơn điện tử. Ngay cả khi chưa bắt buộc, việc sẵn sàng dữ liệu bán hàng cũng giúp nhà thuốc vận hành minh bạch hơn.

Theo bài gốc, hộ kinh doanh có doanh thu trên 01 tỷ đồng/năm phải sử dụng hóa đơn điện tử, có thể là hóa đơn có mã của cơ quan thuế hoặc hóa đơn điện tử khởi tạo từ máy tính tiền, tùy trường hợp áp dụng. Với hộ kinh doanh có doanh thu không vượt 01 tỷ đồng, việc sử dụng hóa đơn điện tử không bắt buộc trong mọi trường hợp nhưng có thể đăng ký nếu đủ điều kiện và có nhu cầu.

Điểm cần chú ý là nếu đang kinh doanh và doanh thu lũy kế vượt ngưỡng, hộ kinh doanh cần đăng ký sử dụng hóa đơn điện tử trong thời hạn được quy định. Bài gốc nêu mốc 30 ngày kể từ ngày cuối cùng của kỳ tính thuế có doanh thu lũy kế trên 01 tỷ đồng. Vì đây là nghĩa vụ pháp lý, chủ nhà thuốc nên kiểm tra lại với cơ quan thuế hoặc đơn vị cung cấp hóa đơn điện tử trước khi triển khai.

Với nhà thuốc có nhiều địa điểm kinh doanh dùng chung mã số thuế, hóa đơn cần thể hiện đúng địa điểm bán hàng. Đây là chi tiết nhỏ nhưng quan trọng, vì dữ liệu hóa đơn, doanh thu theo điểm bán và báo cáo nội bộ cần khớp nhau. Phần mềm quản lý nhà thuốc Omini nên được cấu hình theo từng chi nhánh, quầy bán hoặc điểm kinh doanh để hạn chế nhầm lẫn khi xuất báo cáo.

Doanh nghiệp nhỏ doanh thu từ 01 tỷ đồng/năm trở xuống được lợi gì?

Theo Nghị định 141/2026/NĐ-CP, doanh nghiệp hoặc tổ chức có tổng doanh thu từ 01 tỷ đồng/năm trở xuống có thể được miễn thuế thu nhập doanh nghiệp và miễn tạm nộp thuế thu nhập doanh nghiệp, tùy điều kiện cụ thể. Đây là điểm đáng chú ý với các cơ sở đang cân nhắc chuyển đổi từ hộ kinh doanh lên doanh nghiệp.

Bài gốc nêu rằng quy định này được bổ sung vào Nghị định 320/2025/NĐ-CP. Doanh thu để xác định ưu đãi có thể bao gồm doanh thu bán hàng, cung cấp dịch vụ, doanh thu tài chính và thu nhập khác, chưa trừ các khoản giảm trừ, theo tờ khai quyết toán năm trước nếu hoạt động đủ 12 tháng. Nếu doanh nghiệp hoạt động dưới 12 tháng, doanh thu có thể được quy đổi theo công thức lấy doanh thu thực tế chia cho số tháng hoạt động rồi nhân 12.

Với doanh nghiệp mới thành lập, nếu dự kiến doanh thu không vượt 01 tỷ đồng thì có thể không phải tạm nộp thuế thu nhập doanh nghiệp. Tuy nhiên, nếu cuối năm doanh thu thực tế vượt 01 tỷ đồng, doanh nghiệp vẫn phải kê khai, quyết toán và nộp thuế theo quy định hiện hành. Trường hợp nộp thiếu có thể phát sinh tiền chậm nộp, vì vậy doanh nghiệp nhỏ không nên chỉ dựa vào dự kiến ban đầu.

Một lưu ý quan trọng trong bài gốc là doanh nghiệp là công ty con hoặc có liên kết với doanh nghiệp khác không thuộc diện hưởng ưu đãi. Với chủ nhà thuốc đang mở rộng thành chuỗi, có nhiều pháp nhân hoặc có liên kết kinh doanh, nên hỏi kế toán hoặc cơ quan quản lý để xác định đúng điều kiện áp dụng.

Làm sao xử lý thuế đã nộp thừa nếu doanh thu không vượt 01 tỷ đồng?

Nếu hộ kinh doanh hoặc doanh nghiệp thuộc ngưỡng được miễn nhưng đã nộp thuế, khoản đó có thể được xem là nộp thừa và xử lý theo cơ chế bù trừ hoặc hoàn thuế, theo quy định hiện hành. Chủ nhà thuốc nên lưu đầy đủ chứng từ nộp thuế và dữ liệu doanh thu để làm căn cứ.

Với hộ kinh doanh, bài gốc nêu hai tình huống phổ biến. Thứ nhất, nếu sàn thương mại điện tử hoặc đối tác đã khấu trừ, nộp thay thuế nhưng cuối năm doanh thu không vượt 01 tỷ đồng, phần đã nộp thay có thể được hoàn hoặc bù trừ. Thứ hai, nếu hộ tự kê khai và tự nộp thuế nhưng doanh thu thực tế không vượt 01 tỷ đồng, số thuế đã nộp cũng có thể được xử lý là nộp thừa.

Với doanh nghiệp, nếu đã tạm nộp thuế thu nhập doanh nghiệp quý I/2026 nhưng doanh thu năm dự kiến không vượt 01 tỷ đồng, bài gốc nêu rằng doanh nghiệp không cần tạm nộp các quý còn lại. Khi quyết toán năm, nếu doanh thu thực tế vẫn không vượt 01 tỷ đồng, phần đã tạm nộp được xác định là nộp thừa và có thể hoàn hoặc bù trừ.

Để xử lý tốt phần này, dữ liệu là yếu tố quyết định. Chủ nhà thuốc nên lưu:

• Báo cáo doanh thu theo kỳ.
• Chứng từ nộp thuế hoặc thông tin khấu trừ từ sàn thương mại điện tử.
• Báo cáo bán hàng theo kênh.
• Sao kê tài khoản ngân hàng liên quan đến doanh thu.
• Hồ sơ hóa đơn điện tử nếu đã đăng ký sử dụng.

Phần mềm quản lý nhà thuốc Omini không thay thế cơ quan thuế, nhưng có thể giúp chủ nhà thuốc chuẩn bị dữ liệu rõ ràng hơn trước khi làm việc với kế toán hoặc cơ quan quản lý.

Nhà thuốc nên chuẩn bị gì sau Nghị định 141/2026/NĐ-CP?

Sau Nghị định 141/2026/NĐ-CP, nhà thuốc nên ưu tiên chuẩn hóa dữ liệu doanh thu, hóa đơn và báo cáo bán hàng. Đây là bước thực tế nhất để vừa tận dụng chính sách mới, vừa tránh rủi ro kê khai sai khi doanh thu thay đổi.

Thay vì chỉ quan tâm đến việc “có phải nộp thuế không”, chủ nhà thuốc nên xem đây là cơ hội để nâng cấp cách quản lý. Một cơ sở nhỏ nhưng có dữ liệu rõ ràng sẽ dễ kiểm soát hàng tồn, doanh thu, công nợ, chi phí và nghĩa vụ thuế hơn.

Nhà thuốc nhỏ có cần dùng phần mềm quản lý ngay không?

Có, nếu nhà thuốc muốn theo dõi doanh thu chính xác và giảm phụ thuộc vào sổ tay hoặc file Excel rời rạc. Phần mềm quản lý nhà thuốc Omini phù hợp với nhu cầu ghi nhận bán hàng, quản lý tồn kho, theo dõi lô hạn dùng và tổng hợp báo cáo doanh thu.

Ở giai đoạn đầu, chủ nhà thuốc có thể chưa cần hệ thống quá phức tạp. Nhưng ít nhất nên có các báo cáo cơ bản như doanh thu theo ngày, doanh thu theo tháng, doanh thu theo phương thức thanh toán, doanh thu theo chi nhánh và lịch sử hoàn trả. Các dữ liệu này rất hữu ích khi cần xác định doanh thu lũy kế so với ngưỡng 01 tỷ đồng/năm.

Khi nào nên hỏi cơ quan thuế hoặc kế toán?

Nên hỏi cơ quan thuế hoặc kế toán khi doanh thu tiến sát ngưỡng 01 tỷ đồng/năm, khi bán hàng đa kênh, khi có giao dịch qua sàn thương mại điện tử hoặc khi chuẩn bị đăng ký hóa đơn điện tử. Các quy định pháp lý có thể có hướng dẫn chi tiết theo từng địa phương và từng mô hình kinh doanh.

Ngoài ra, nếu nhà thuốc có nhiều điểm bán, có công ty liên kết, vừa bán trực tiếp vừa bán online hoặc đang chuyển đổi từ hộ kinh doanh sang doanh nghiệp, việc tham vấn chuyên môn là cần thiết. Bài viết này chỉ mang tính tham khảo và không thay thế tư vấn pháp lý, kế toán hoặc hướng dẫn chính thức từ cơ quan quản lý.

Câu hỏi thường gặp

Hộ kinh doanh nhà thuốc doanh thu dưới 01 tỷ đồng có phải nộp thuế không?

Theo nội dung bài gốc về Nghị định 141/2026/NĐ-CP, hộ kinh doanh có doanh thu không vượt 01 tỷ đồng/năm không phải nộp thuế giá trị gia tăng và thuế thu nhập cá nhân. Khi áp dụng thực tế, chủ nhà thuốc nên kiểm tra với cơ quan thuế địa phương.

Nhà thuốc doanh thu trên 01 tỷ đồng có phải dùng hóa đơn điện tử không?

Theo bài gốc, hộ kinh doanh có doanh thu trên 01 tỷ đồng/năm thuộc diện phải sử dụng hóa đơn điện tử. Hình thức áp dụng cụ thể nên được đối chiếu với hướng dẫn của cơ quan thuế và đơn vị cung cấp hóa đơn điện tử.

Nếu đã nộp thuế nhưng cuối năm doanh thu không vượt 01 tỷ đồng thì xử lý thế nào?

Khoản thuế đã nộp có thể được xem là nộp thừa và xử lý theo cơ chế bù trừ hoặc hoàn thuế, tùy hồ sơ và hướng dẫn của cơ quan quản lý. Chủ cơ sở nên lưu chứng từ nộp thuế, dữ liệu doanh thu và thông tin khấu trừ nếu có.

Doanh nghiệp nhỏ doanh thu từ 01 tỷ đồng/năm trở xuống có được miễn thuế thu nhập doanh nghiệp không?

Theo nội dung bài gốc, doanh nghiệp hoặc tổ chức có tổng doanh thu không vượt 01 tỷ đồng/năm có thể được miễn thuế thu nhập doanh nghiệp và miễn tạm nộp. Tuy nhiên, có ngoại lệ như doanh nghiệp liên kết hoặc công ty con.

Phần mềm quản lý nhà thuốc Omini có thay thế tư vấn thuế không?

Không. Phần mềm quản lý nhà thuốc Omini hỗ trợ ghi nhận doanh thu, tồn kho, báo cáo bán hàng và dữ liệu vận hành. Việc xác định nghĩa vụ thuế cuối cùng vẫn nên kiểm tra với kế toán hoặc cơ quan quản lý theo quy định hiện hành.